Puuduvad geenid tõenäolisemalt autismiga inimestel
See tähendab, et neil inimestel - 7 protsendil uurimisrühmast - oli ühe või mitme geeni üks eksemplar, kui neil oleks pidanud olema kaks, märkisid New Yorgis Siinai mäel asuva Icahni meditsiinikooli teadlased.
"See on esimene järeldus, et väikesed kustutused, mis mõjutavad ühte või kahte geeni, näivad olevat levinud autismi korral ja et need kustutused suurendavad häire arenguriski," ütles uuringu juhtivteadur, Joseph D. Buxbaum, Ph.D. , psühhiaatria, geneetika ning genoomikateaduste ja neuroteaduste professor.
"Seda järeldust tuleb laiendada teistes ASD sõltumatutes valimites, et saaksime tõeliselt aru saada, kuidas risk avaldub."
See protsess on Buxbaumi sõnul nüüd pooleli. Autismi sekveneerimise konsortsium, mis koosneb enam kui 25 asutusest, sai riiklikelt tervishoiuinstituutidelt 7 miljoni dollari suuruse toetuse, et jätkata Siinai mäe tuhandete ASD-de genoomide analüüsimist.
Autism, mis mõjutab umbes 1 protsenti elanikkonnast, on arenguhäire, mille arvatavasti põhjustab geneetiliste ja keskkonnategurite keeruline vastastikune mõju. Ehkki häiret saab pärida, ei saa Buxbaumi sõnul enamikku autismi juhtudest seostada teadaolevate pärilike põhjustega.
Kuigi uuringud on näidanud, et autismile võib kaasa aidata kuni 1000 geeni või genoomset piirkonda, on enamik uuringuid otsinud kas ühe punkti mutatsioone - muutust ühes DNA tähes geenil - või suuri genoomi alasid , mis hõlmab paljusid geene, see on muudetud.
Oma uuringu jaoks skaneerisid teadlased geenide järjestamise tehnoloogia abil sadade inimeste genoomi. Nad otsisid väikest koopiate arvu varieerumist - geenide kustutamist või dubleerimist - autistlike isikute ja häireta inimeste kontrollrühma vahel.
Uuringu läbiviimiseks uurisid nad proovikomplektis kõiki 22 000 inimese geeni eksomejärjestuse abil. Seejärel analüüsisid nad neid andmeid programmi eXome Hidden Markov Model (XHMM) abil. Uurijate sõnul on vahendid esimesed, mis suudavad leida genoomist ühe geenisuuruse kustutamise või täiendamise.
"See annab meile võimu esimest korda teha üks proov vereproovist ja võrrelda seda võrdlusgenoomiga, et otsida mutatsioone ja väikest koopiate arvu variatsiooni patsientidel," selgitas Buxbaum.
Teadlased analüüsisid andmebaasi, mis koosnes 431 autismi juhtumist ja 379 sobitatud kontrollist, kokku 811 inimest. Nad leidsid 803 geenide deletsiooni autistlikus rühmas ja 583 geenide eemaldamist kontrollrühmas. Samuti leidsid nad, et autismiga inimestel on suurem tõenäosus, et neil on mitu väikest kustutust.
"Nüüd on teada, et ebatäiuslik geenikoopiate arv on üks peamisi inimeste varieerumise allikaid," ütles Buxbaum.
“Üks põhjus, miks me üksteisest eristume, on geenide lisamine või kustutamine, mis on sageli pärilikud. Kuid ASD-s esinevatest täiendavatest kustutustest ei ole kõik tingitud geneetilisest pärilikkusest. Mõned neist ilmnevad munaraku või sperma arengus ja sel viisil arenevad kustutused kipuvad olema seotud häirega. "
Teadlased leidsid, et märkimisväärne osa geenide deletsioonidest autismiga inimestel oli seotud autofaagiaga - protsessiga, mis hoiab rakke tervena, asendades membraane ja organelle.
"On hea põhjus arvata, et autofaagia on aju arenguks tõesti oluline, kuna aju tekitab palju rohkem sünapsi kui vaja ja üleliigne tuleb tagasi kärpida," ütles Buxbaum. "Liiga paljudel või liiga vähestel sünapsidel on sama efekt, mis ei pane suhtlust eriti hästi tööle. See võib tähendada, et mõned sünaptilised ühendused tulevad liiga hilja ega pruugi korralikult tahkuda. "
Teadlaste sõnul usuvad nad American Journal of Human Geneticson kliiniline tähendus.
"Peamised koopiate arvu variatsioonid - need, mis ilmnevad pidevalt autistlikus populatsioonis - võivad mõjutada geneetilisi teste," järeldas Buxbaum.
Allikas: Siinai mäe haigla / Siinai mäe meditsiinikool
