Twitter aitab tuvastada ohtlikke ravimite koostoimeid

Twitteri andmeid kaevandav uus tarkvara suudab tuvastada potentsiaalselt ohtlikud ravimite koostoimed ja kõrvaltoimed enne, kui need ilmuvad traditsioonilistes andmebaasides.

Vermonti ülikooli interdistsiplinaarsed arvutiteadlased lõid arvutiprogrammi, mis võimaldab tõhusalt otsida Twitterist paljude ravimite ja ravimite nimedest miljoneid säutse - ja koostada kaardi nende ühendamise kohta -, kasutades neid ühendavaid # hashtage.

Teadlaste sõnul võib tarkvara avastada potentsiaalselt ohtlikke ravimite koostoimeid ja tundmatuid kõrvaltoimeid enne, kui need ilmuvad meditsiinilistes andmebaasides, nagu PubMed, või isegi enne, kui arstid ja teadlased neist üldse kuulnud on.

"Meie uus algoritm on suurepärane võimalus teha avastusi, mida saavad jälgida ja testida eksperdid, näiteks kliinilised uurijad ja proviisorid," ütles uue tööriista loomist juhtinud Vermonti ülikooli arvutiteadlane Ahmed Abdeen Hamed.

Aruanne algoritmi toimimise ja selle esialgsete avastuste kohta ilmub veebis Biomeditsiinilise informaatika ajakiri.

"Me ei pruugi teada, milline on vastastikmõju, kuid selle lähenemisega võime kiiresti leida selgeid tõendeid uimastite kohta, mis on räsimärkide abil omavahel seotud," ütles Hamed.

Teadlaste arvates võiks uut lähenemist kasutada ka avalike teadete loomiseks, ütles Hamed, enne kliinilise uuringu alustamist või enne, kui tervishoiuteenuse osutajad on värskendusi saanud. "See võib meile öelda: me võime siin näha ravimite ja ravimite koostoimeid," ütles Hamed. "Ettevaatust."

Uurijad usuvad ka, et meetod aitab üle saada meditsiiniuuringute pikaajalisest probleemist: avaldatud uuringud ei ole liiga sageli seotud uute teaduslike leidudega, sest digitaalraamatukogud „kannatavad harva märgistamise all“. See tähendab, et uuringutega seotud olulise digitaalse teabe, näiteks märksõnade ja metaandmete ajakohastamine on töömahukas, sageli viivitatud või puudulik.

"Twitteri hashtagide kaevandamine võib anda meile seose esilekerkivate teaduslike tõendite ja PubMedi vahel," ütles USA riikliku meditsiiniraamatukogu hallatav tohutu andmebaas, ütles Hamed. Kasutades oma uut algoritmi, on Vermonti meeskond loonud veebisaidi, mis võimaldab uurijal uurida seoseid otsinguterminite (näiteks „albuterool”), PubMedis indekseeritud olemasolevate teaduslike uuringute ning terminite ja uuringutega seotud Twitteri räsimärkide vahel.

Varasemad uuringud on näidanud, et Twitterit saab kaevandada halbade ravimite koostoimete jaoks, kuid Vermonti meeskond edendab seda ideed, keskendudes leidmiseks räsimärkides sisalduvale eristavale teabele - näiteks "# overprescribed", "#kidneystoneprobs" ja "#skinswelling". uued ühendused.

"Iga üksik hashtag toimib peaaegu nagu inimese aju neuron, saates kindla signaali," kirjutavad teadlased, mis võib paljastada üllatavat rada kahe või enama ravimi vahel.

Meeskonna lähenemisviis hõlmab selle ehitamist, mida nad nimetavad "K-H võrguks" - sisuliselt tihedat kaarti märksõnade ja räsimärkide vahelistest linkidest - ja seejärel palju "müra ja prügikasti" välja lõikamist, "ütleb Hamed," see on Twitter! " - leida võrgus kesksed mõisted. Seejärel otsib algoritm nimega HashPairMiner selles puhastatud võrgus kõige lühemaid teid otsinguterminipaari ja nende sekkuvate räsimärkide vahel.

Riikliku Teadusfondi toetatud projekti üldeesmärk on "avastada mis tahes seos kahe ravimi vahel, mis pole teada", ütles Hamed. Kuid hüpoteesi tõekspidamiseks - et Twitteris andmete kaevandamine võib leida tundmatuid ravimite koostoimeid - soovis meeskond näidata, et nende lähenemine "võib tekitada juba teadaolevaid koostoimeid", ütleb Tamer Fandy, farmaatsiateaduste professor Albany farmaatsiakolledži ülikoolilinnak Vermontis ja uue uuringu kaasautor.

"See on nii," ütles Hamed. Ühes uue uuringu näites tuvastati algoritmi abil aspiriini ja teadaolevalt koostoimes olevate allergiaravimite benadrüüli vaheline tee; ühel juhul ühendas need kaks ravimit - võib-olla mitte liiga üllatavalt - räsimärgendiga "#happythanksgiving".

Uus süsteem sai alguse sellest, mida Vermonti ülikooli Hamed algselt pidas 2013. aasta novembris eksituseks. Praeguse algoritmi varasem versioon „avastas midagi šokeerivat: ibuprofeen ja meditsiiniline marihuaana - mis te arvate, et neil pole midagi pistmist - olid mida ühendab hashtag nimega # Alzheimer, ”ütleb Hamed.

"Ma arvasin, et see peab olema viga. Vaatasin oma koodi. Kordasin oma katset. Kogusin erinevaid säutsuandmekogumeid - ja sain sama tulemuse, ”sõnas ta. Kuid ta ei leidnud PubMedi ega muude kliinilise kirjanduse andmebaaside ühendusele tuge. Tegelikult viitas ainus uuring, mille ta leidis, alates 1989. aastast vastupidist, et ibuprofeeni ja marihuaana vahel ei olnud koostoimet.

Selgus, et Hamed oli Twitterversist tahtmatult avastanud inimesi, kes jagasid uhiuue eelretsenseeritud uuringu tulemusi, mis viitasid sellele, et ibuprofeenil on teatud võime blokeerida või vähendada regulaarse marihuaana kasutamise mälu kahjustavaid mõjusid, mida on seostatud Alzheimeri tõve arenguga. "See ilmus Twitteris enne PubMedi," ütles Hamed.

Kui rohkem riike legaliseerib marihuaanat, võib Hamed öelda, et arutelu selle koostoime üle teiste ravimitega võib olla kasvav - enne teadlaste suutlikkust neid koostoimeid uurida.

"Kui me suudame muret tuvastada - öelge peavalude või vererõhu languse või muu kohta," ütles ta, "mis võib viia apteekrid või teadlased hüpoteesini, millele võib järgneda kliiniline uuring või muu meditsiiniline test. ”

Allikas: Vermonti ülikool