Videomängude tehnoloogia edendab vähiuuringuid
Uus suund teadusuuringutes on videomängude tehnoloogia kasutamine inimese koe simuleerimiseks.
Wake Metsa ülikooli teadlased kasutavad videomängupilte nii realistlikuks muutvat tehnoloogiat graafikaprotsessorid (GPU), et simuleerida inimrakkude sisemist tööd.
Biofüüsik ja arvutiteadlane dr Samuel Cho ütles, et videomängude populaarsus on olnud ka jumalakartus, aidates langetada graafikaprotsessorite hinda, et neid saaks nüüd uurimiseks kasutada.
Lisaks võimaldab tehnoloogia nüüd Cho'l näha täpselt, kuidas rakud elavad, jagunevad ja surevad. Ja see avab tema sõnul võimalusi kasvajaid tapvate ravimite uuteks sihtmärkideks.
Cho uusim kriitilise RNA molekuli arvutisimulatsioon, mis on inimese telomeraasi ensüümi komponent, valgustab selle molekuli voltimisel ja avanemisel seni tundmatuid varjatud olekuid.
Tema uurimistöö tulemused ilmuvad Ameerika Keemia Seltsi ajakiri.
Inimese telomeraasi ensüümi leidub ainult vähirakkudes. See lisab rakkude jagunemisel pisikesed molekulid, mida nimetatakse telomeerideks, DNA ahelate otstesse - takistades sisuliselt rakkude surma.
"Rakk paljuneb üha uuesti ja see on vähi määratlus," ütles Cho. "Teades, kuidas telomeraas klapib ja toimib, pakume vähiravi uurimiseks uue ala."
Visuaalne esitus annab teadlastele palju täpsema ülevaate selle toimimisest. See võib omakorda lubada uute ravimite väljatöötamist, mis võivad blokeerida ensüümi toime ja peatada vähirakkude kasvu.
Täpsemalt, uus ravim peataks inimese telomeraasi ensüümi lisamise DNA-le, nii et kasvajarakk sureb.
Cho uurib praegu videomängimise tehnoloogia kasutamist bakteriaalse ribosoomi uurimiseks - molekulaarsüsteem, mis on 200 korda suurem kui inimese telomeraasi ensüümi RNA molekul.
Tema uurimisrühm on nende rakusimulatsioonide teostamiseks hakanud kasutama graafikaprotsessoriteks nimetatud graafikakaarte, mis on palju kiirem kui tavaliste arvutuste kasutamine.
"Oleme selle tehnoloogia kaaperdanud, et teha simulatsioone väga-väga kiiresti palju suuremates biomolekulaarsetes süsteemides," ütles Cho.
Ilma GPU-deta oli Cho hinnangul selle simulatsiooni programmeerimine võtnud rohkem kui 40 aastat. Hämmastaval kombel võimaldab tehnoloogia kasutamine uuringuid teha vaid mõne kuuga.
Allikas: Wake Metsa ülikool
