Uue skisofreenia uuringus keskendutakse valgu ja valgu koostoimetele
Sarnaselt inimestega saab geeni kohta palju teada, kui vaadata firmat, mida see hoiab, ja jälgida, kuidas see käitub. Püüdes avastada rohkem skisofreenia arengut puudutavaid vihjeid, uurisid Pittsburghi ülikooli meditsiinikooli teadlased, kuidas skisofreeniaga seotud geenide poolt toodetud valgud omavahel suhtlevad.
"Me võime järeldada, mida valk võib teha, kontrollides oma ettevõttet, mida ta hoiab," ütles vanemteadur Madhavi Ganapathiraju, Ph.D., Pitti meditsiinikooli biomeditsiinilise informaatika dotsent.
"Näiteks kui ma tean, et teil on palju hokit mängivaid sõpru, võib see tähendada, et olete ka hokiga seotud. Samamoodi, kui näeme, et tundmatu valk interakteerub näiteks mitmete närvisignaalides osalevate valkudega, on suur tõenäosus, et ka tundmatu üksus osaleb selles. "
Lähiajaloos on teadlased läbi viinud palju kogu genoomi hõlmavaid assotsiatsiooniuuringuid (GWAS), mis on edukalt tuvastanud skisofreenia suurenenud riskiga seotud geenivariandid. Teadlased väidavad siiski, et valkude kohta, mida need geenid toodavad, mida nad teevad ja kuidas nad suhtlevad, on suhteliselt vähe teada.
"GWAS-i uuringud ja muud uurimistööd on näidanud meile, millised geenid võivad skisofreenia korral olla asjakohased," ütles Ganapathiraju. "See, mida oleme teinud, on järgmine samm. Püüame mõista, kuidas need geenid omavahel suhestuvad, mis võiks meile näidata selle haiguse jaoks olulisi bioloogilisi radu. "
Lühidalt öeldes valmistab iga geen valke ja need valgud interakteeruvad tavaliselt bioloogilises protsessis. Nende valkude omavahelise käitumise uurimine võib valgustada veel uurimata geeni rolli, paljastada skisofreeniaga seotud rajad ja bioloogilised protsessid ning selle seose teiste keeruliste haigustega.
Pärast uue arvutusliku mudeli, mida nimetatakse ülitäpse valgu koostoime ennustamiseks (HiPPIP), väljatöötamist ja kasutamist avastasid teadlased skisofreeniaga seotud geenidega seotud üle 500 uue valgu-valgu koostoime (PPI).
Teadlased lisavad, et kuigi ajalooliselt tuvastatud skisofreeniaga seotud geenid ja GWAS-i kaudu olid vähe kattuvad, näitas mudel, et neil on rohkem kui 100 levinud interaktorit. Tulemused võivad viia selle vaimuhaiguse bioloogilise aluse parema mõistmiseni ning ka raviviisini.
Tulemused avaldatakse Internetis Internetis npj skisofreenia, Nature Publishing Groupi ajakiri.
Allikas: Pittsburghi ülikooli terviseteaduste koolid
