Uuringus leitakse depressiooniga seotud genoomseid saite

Uues genoomiuuringus tuvastati esmakordselt 15 genoomi piirkonda, mis näivad olevat seotud Euroopa esivanemate depressiooniga.

Uuringus kasutasid uurijad osalejate registreerimiseks uudset meetodit. Osalejate värbamise ja seejärel geenide sekveneerimise asemel analüüsisid teadlased andmeid, mida on juba jaganud inimesed, kes olid veebipõhise teenuse kaudu ostnud oma geneetilised profiilid ja otsustanud osaleda selle uurimisvalikus.

See võimaldas kasutada tohutu valimi suuruse statistilist jõudu, et tuvastada nõrgad geneetilised signaalid, mis on seotud diagnoosiga, mis on tõenäoliselt jälgitav mitme põhihaiguse protsessiga. Seda rahvahulgast pärinevate andmete loomingulist kasutamist kinnitasid uuringus traditsiooniliste geneetikakäsitluste tulemused.

Uuringu tulemused on avaldatud eelmises veebiväljaandes aastalLooduse geneetika.

"Haiguse riski mõjutavate geenide tuvastamine on esimene samm haigusbioloogia enda mõistmise suunas, mis annab meile eesmärgid uute ravimeetodite väljatöötamiseks," ütleb Massachusettsi üldhaigla magistrikraad Roy Perlis -aruande korrespondentautor.

"Üldiselt peaks depressiooniga seotud geenide leidmine aitama selgitada, et tegemist on ajuhaigusega, mis loodetavasti vähendab seda tüüpi haigustega endiselt seotud häbimärki."

Kuigi on hästi teada, et depressioon võib esineda perekondades, ei ole enamik varasemaid geneetilisi uuringuid suutnud tuvastada depressiooni riski mõjutavaid variante.

Ühes uuringus leiti küll kaks genoomset piirkonda, mis võivad kaasa aidata hiinlaste haiguste riskile, kuid need variandid on teistes etnilistes rühmades äärmiselt haruldased.

Perlis ja tema kolleegid märgivad, et depressiooni ilmnemise ja patsiente mõjutavate vormide arv tähendab, et nagu ka teiste psühhiaatriliste häirete puhul, mõjutavad seda tõenäoliselt paljud geenid, mille mõju võib olla liiga peen, et seda leida varasemates suhteliselt väikestes uuringutes.

Erinevalt tavapärastest uuringus osalejate värbamise meetoditest - mis hõlmavad võimalike osalejate otsimist ja registreerimist ning seejärel igakülgse intervjuu läbiviimist enne iga inimese tegelikku genotüüpimist - kasutati selles uuringus andmeid, mis koguti otse tarbijale mõeldud geneetiliste testide ettevõtte 23andMe klientidelt, kes olid nõus osalema uurimistöös.

Osalemine hõlmab küsitlustele vastamist ja haigusloo ning füüsilise ja demograafilise teabe täiendamist. 23andMe uurijate platvorm kasutab koondatud mittetuvastavaid andmeid.

Praeguse uuringu jaoks analüüsisid uurijad esmalt levinud geneetilist variatsiooni, kasutades andmeid, mis pärinesid andmebaasist 23andMe pärit enam kui 300 000 Euroopa päritolu isikult, kellest enam kui 75 000 teatas depressioonist või on ravitud depressiooni ja enam kui 230 000, kellel pole esinenud depressioon.

Selle analüüsi käigus tuvastati depressiooniriskiga oluliselt seotud kaks genoomset piirkonda - üks sisaldab halvasti mõistetud geeni teadaolevalt ekspresseeritavat geeni ja teine, mis on varem seotud epilepsia ja vaimupuudega.

Uurimisrühm ühendas selle teabe väiksemate kogu genoomi hõlmavate uuringute rühma andmetega, milles osales umbes 9200 inimest, kellel oli anamneesis depressioon ja 9500 kontrolli ja seejärel analüüsiti 23andMe kliendi teise rühma proovides võimalike riskigeenide saite - peaaegu 45 800 depressiooni ja 106 000 kontrolliga.

Tulemused tuvastasid depressiooni diagnoosimisega märkimisväärselt seotud 15 genoomset piirkonda, sealhulgas 17 spetsiifilist saiti. Paljud neist saitidest asuvad geenides või nende läheduses, mis teadaolevalt osalevad aju arengus.

"Neurotransmitteritel põhinevad mudelid, mida me praegu depressiooni raviks kasutame, on üle 40 aasta vanad ja me vajame tõesti uusi ravieesmärke. Loodame, et nende geenide leidmine suunab meid uudsete ravistrateegiate poole, ”ütles Harvardi meditsiinikooli psühhiaatria dotsent Perlis.

„Teine meie uuringu peamine võtmetähtsus on see, et geeniuuringute traditsiooniline viis pole ainus toimiv viis. Olemasolevate suurte andmekogumite või biopankade kasutamine võib olla palju tõhusam ja kasulik teiste psühhiaatriliste häirete korral, näiteks ärevushäirete korral, kus ka traditsioonilised lähenemisviisid pole olnud edukad. "

Allikas: Massachusettsi üldhaigla